クローニングベクターは、クローニングの目的で外来 DNA フラグメントを挿入できる安定した DNA の小片です。クローニングベクターには多くの種類がありますが、最も一般的に使用されるのは遺伝子組み換えプラスミドです。クローニングは通常、まず大腸菌を用いて行われ、大腸菌におけるクローニングベクターはプラスミド、バクテリオファージ、コスミド、細菌人工染色体（BAC）で構成されます。
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