クラリサ・エリカ
単一細胞RNAシーケンシングのデータから、異なる細胞タイプの分子多様性が明らかになる。マウス脊髄の細胞タイプアトラスの最近の出版物はまだ統合されていない。ここでは、単一細胞トランスクリプトームデータを使用して、さまざまなデータセットを単一の参照フレームに統合し、脊髄細胞タイプのアトラスを作成する。出生後の細胞タイプの相互作用の階層的フレームワークを提示し、場所を組織化の最高レベルとし、次に神経伝達物質の状態、ファミリー、および数十の精製された集団が続く。成体脊髄の各タイプの神経細胞の地理的分布をマップし、それぞれの組み合わせマーカーコードを検証する。また、いくつかの出生後の細胞タイプ間の複雑な系統リンクも示す。細胞タイプの識別の標準化を支援するために、オープンソースの細胞タイプ分類器SeqSeekも作成する。この研究により、さまざまなタイプの脊髄細胞、それらの分子配置、およびそれらの遺伝子発現プロファイルの統合的な理解が得られる。