組織病理学 (または組織学) には、拡大レンズの下で検査対象の組織全体を検査することが含まれます。3 つの基本的な種類の例が病理学研究施設から入手されました。より大きな例では、外科手術中に排出される臓器全体またはその一部が組み込まれています。イラストには、子宮摘出術後の子宮、結腸摘出術後の広大な内部、または扁桃摘出術後の扁桃腺が含まれています。
臓器全体ではなく組織の一部が生検として採取されますが、通常は、患者がまだ意識を保っていても安静にしている間に実行できる、より少ない外科的方法が必要です。生検には、組織を外科用刃で取り除く摘出生検（例、疑わしいほくろの皮膚の摘出）や、疑わしい塊に針を埋め込んで、感染の可能性がある組織の這いまたは中心を排出する中心生検が組み込まれています。拡大鏡を使って分析します（胸の隆起を調べるためなど）。
液体および組織の小片（細胞の集まりではなく単一の細胞、たとえば肺周囲の液体内部）は、細針穿刺（FNA）によって取得できます。これは、中心生検の一部として使用される針よりも細い針を使用して行われますが、比較戦略が使用されます。この種の物質は通常、強いものではなく液体であるため、組織学ではなく細胞学に提出されます（細胞病理学を参照）。